Atualmente, o Departamento de Assistência Farmacêutica - DAF/SEMUSA, contém três divisões, sendo; Divisão Estratégica - DIVE/DAF/SEMUSA; Divisão de Apoio ao Diagnóstico - DAD/DAF/SEMUSA; Divisão de Logística - DIVL/CAF/DAF/SEMUSA; onde a Central de Abastecimento Farmacêutico, é operado pela Divisão de Logística - DIVL. 

Modelo do Organograma Atual de Funcionamento do Departamento de Assistência Farmacêutica - DAF/SEMUSA